伯克利在其学科课程设置方面也有其独具特色的一面，尤其是在专业的基础课程方面，除了计算机科学相关课程外，对于没有编程基础的学生特意开了符号编程入门课程。而对于编程基础的学生来说，可以选择多语言环境下的自主学习课程，包括C、Fortran、C++、Java，以及UNIX的使用等。但是基本所有的学生在第二学期都需要学习非常独特的基础课，计算机程序的结构与解释、数据结构、计算机结构。